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RM 8393人類(lèi)DNA標準物質(zhì)(中國血統)的操作注意

發(fā)布時(shí)間: 2023-10-07  點(diǎn)擊次數: 256次

RM 8393人類(lèi)DNA標準物質(zhì)(中國血統)的操作注意

       本標準物質(zhì)(RM)用于驗證、優(yōu)化和工藝評估。它由來(lái)自個(gè)人基因組計劃(ID hu91BD69)的東亞(中國)血統的男性基因組樣本組成,可用于評估基因組測序中變異調用的性能。RM 8393的單元由含有從來(lái)自Coriell醫學(xué)研究所(新澤西州卡姆登)的單個(gè)大生長(cháng)的人類(lèi)淋巴母細胞系GM24631(標記為HG-005)中提取的人類(lèi)基因組DNA的小瓶組成。小瓶含有約10µg的基因組DNA,DNA在TE緩沖液中(10mM TRIS,1mM EDTA,pH 8.0)。

品牌:NIST標準品

RM Number(貨號):RM 8393

DescriptionHuman DNA for Whole-Genome Variant Assessment (Son of Chinese Ancestry) (HG-005)

描述:人類(lèi)DNA標準物質(zhì)(中國血統)

Unit of Issue(產(chǎn)品規格):1 vial

NIST另有10支裝可選

8393-01-500.jpg

RM 8393人類(lèi)DNA標準物質(zhì)(中國血統)的操作注意

       儲存:RM 8393儲存在NIST的–20°C溫度下,但將與冷凍包一起裝運,可能不會(huì )冷凍到達。收到后,RM 8393應在–20°C的黑暗中長(cháng)期儲存,或在4°C的暗處短期儲存(如果即將使用)。

       使用:建議將vcf與基準vcf進(jìn)行比較后,只有基準區域內的變體才會(huì )被視為真陽(yáng)性、假陽(yáng)性和假陰性。此外,為了了解假陽(yáng)性和假陰性的原因,包括基準集中錯誤的可能性,強烈建議用戶(hù)使用基因組瀏覽器手動(dòng)檢查假定假陽(yáng)性和偽陰性子集周?chē)膶R讀數。為了開(kāi)發(fā)性能指標的標準化定義和工具,以比較具有不同表示的變體調用,全球基因組學(xué)和健康基準團隊聯(lián)盟發(fā)布了在人類(lèi)基因組中基準種系小變體調用的實(shí)踐,我們強烈建議如下。隨著(zhù)測序技術(shù)和分析方法的改進(jìn),這些基準調用和區域將用不同目錄中文件的精細版本進(jìn)行更新,本調查報告將定期更新,以反映重要的新版本。當前版本包含來(lái)自基因組參考聯(lián)盟的GRCh37和GRCh38參考組件的小變體基準集。參考文獻4中描述了該基因組的各種技術(shù)的數據集。


部分NIST標準物質(zhì)產(chǎn)品目錄(僅列舉小部分):

RM 8376用于檢測和鑒定的微生物病原體 DNA 標準品20 tubes
SRM 2383a嬰兒食品復合材料4 x 70 g
SRM 1958強化人血清中的有機污染物5 vials x 10.7 mL
SRM 909c冷凍人血清3 vials x 2 mL
SRM 3186磷酸根陰離子 (PO43-) 標準溶液5 x 10 mL
SRM 2775鑄造用焦炭中的硫50 g
SRM 2385菠菜泥4 x 70 g
SRM 1223鉻鋼disk
SRM 1082香煙點(diǎn)火強度標準1 carton (200 cigarettes)
SRM 2556用過(guò)的汽車(chē)催化劑(顆粒)70 g
SRM 628鋅基壓鑄合金 D(塊狀)block
SRM 125bLA鋼,高硅100 g
SRM 762磁矩標準 - 鎳盤(pán)6 mm dia


聯(lián)


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